Protein–RNA interactions for Protein: A2A588

Krtap1-3, Keratin-associated protein 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-3A2A588 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krtap1-3A2A588 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krtap1-3A2A588 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krtap1-3A2A588 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krtap1-3A2A588 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krtap1-3A2A588 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krtap1-3A2A588 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krtap1-3A2A588 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krtap1-3A2A588 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krtap1-3A2A588 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krtap1-3A2A588 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Krtap1-3A2A588 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krtap1-3A2A588 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krtap1-3A2A588 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krtap1-3A2A588 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krtap1-3A2A588 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krtap1-3A2A588 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krtap1-3A2A588 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krtap1-3A2A588 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krtap1-3A2A588 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krtap1-3A2A588 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krtap1-3A2A588 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krtap1-3A2A588 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krtap1-3A2A588 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krtap1-3A2A588 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krtap1-3A2A588 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krtap1-3A2A588 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krtap1-3A2A588 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krtap1-3A2A588 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krtap1-3A2A588 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krtap1-3A2A588 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Krtap1-3A2A588 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krtap1-3A2A588 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krtap1-3A2A588 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krtap1-3A2A588 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Krtap1-3A2A588 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krtap1-3A2A588 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krtap1-3A2A588 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krtap1-3A2A588 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krtap1-3A2A588 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krtap1-3A2A588 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krtap1-3A2A588 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krtap1-3A2A588 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krtap1-3A2A588 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krtap1-3A2A588 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krtap1-3A2A588 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krtap1-3A2A588 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krtap1-3A2A588 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krtap1-3A2A588 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krtap1-3A2A588 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krtap1-3A2A588 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Krtap1-3A2A588 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krtap1-3A2A588 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krtap1-3A2A588 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krtap1-3A2A588 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Krtap1-3A2A588 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krtap1-3A2A588 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krtap1-3A2A588 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krtap1-3A2A588 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krtap1-3A2A588 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krtap1-3A2A588 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krtap1-3A2A588 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krtap1-3A2A588 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krtap1-3A2A588 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krtap1-3A2A588 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krtap1-3A2A588 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krtap1-3A2A588 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Krtap1-3A2A588 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Krtap1-3A2A588 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krtap1-3A2A588 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Krtap1-3A2A588 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krtap1-3A2A588 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krtap1-3A2A588 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krtap1-3A2A588 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krtap1-3A2A588 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krtap1-3A2A588 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krtap1-3A2A588 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krtap1-3A2A588 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krtap1-3A2A588 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krtap1-3A2A588 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krtap1-3A2A588 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krtap1-3A2A588 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krtap1-3A2A588 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krtap1-3A2A588 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krtap1-3A2A588 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krtap1-3A2A588 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krtap1-3A2A588 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krtap1-3A2A588 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krtap1-3A2A588 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krtap1-3A2A588 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krtap1-3A2A588 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krtap1-3A2A588 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Krtap1-3A2A588 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krtap1-3A2A588 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krtap1-3A2A588 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krtap1-3A2A588 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krtap1-3A2A588 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krtap1-3A2A588 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krtap1-3A2A588 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krtap1-3A2A588 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms