Protein–RNA interactions for Protein: A0A5B9

TRBC2, T-cell receptor beta-2 chain C region, humanhuman

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Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC2A0A5B9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRBC2A0A5B9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRBC2A0A5B9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRBC2A0A5B9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRBC2A0A5B9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRBC2A0A5B9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRBC2A0A5B9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRBC2A0A5B9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRBC2A0A5B9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRBC2A0A5B9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRBC2A0A5B9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRBC2A0A5B9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRBC2A0A5B9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRBC2A0A5B9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRBC2A0A5B9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRBC2A0A5B9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRBC2A0A5B9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRBC2A0A5B9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRBC2A0A5B9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRBC2A0A5B9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRBC2A0A5B9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRBC2A0A5B9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRBC2A0A5B9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRBC2A0A5B9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRBC2A0A5B9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRBC2A0A5B9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRBC2A0A5B9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRBC2A0A5B9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRBC2A0A5B9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRBC2A0A5B9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRBC2A0A5B9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRBC2A0A5B9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRBC2A0A5B9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRBC2A0A5B9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRBC2A0A5B9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRBC2A0A5B9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRBC2A0A5B9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRBC2A0A5B9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRBC2A0A5B9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRBC2A0A5B9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRBC2A0A5B9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRBC2A0A5B9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRBC2A0A5B9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRBC2A0A5B9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRBC2A0A5B9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRBC2A0A5B9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRBC2A0A5B9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRBC2A0A5B9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRBC2A0A5B9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRBC2A0A5B9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRBC2A0A5B9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRBC2A0A5B9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRBC2A0A5B9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRBC2A0A5B9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRBC2A0A5B9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRBC2A0A5B9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRBC2A0A5B9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRBC2A0A5B9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRBC2A0A5B9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRBC2A0A5B9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRBC2A0A5B9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRBC2A0A5B9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRBC2A0A5B9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRBC2A0A5B9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRBC2A0A5B9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRBC2A0A5B9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRBC2A0A5B9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRBC2A0A5B9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRBC2A0A5B9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRBC2A0A5B9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRBC2A0A5B9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRBC2A0A5B9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRBC2A0A5B9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRBC2A0A5B9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRBC2A0A5B9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRBC2A0A5B9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRBC2A0A5B9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRBC2A0A5B9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRBC2A0A5B9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRBC2A0A5B9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRBC2A0A5B9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRBC2A0A5B9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRBC2A0A5B9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRBC2A0A5B9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRBC2A0A5B9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRBC2A0A5B9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRBC2A0A5B9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRBC2A0A5B9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRBC2A0A5B9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRBC2A0A5B9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRBC2A0A5B9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRBC2A0A5B9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRBC2A0A5B9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRBC2A0A5B9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRBC2A0A5B9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRBC2A0A5B9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRBC2A0A5B9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRBC2A0A5B9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRBC2A0A5B9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRBC2A0A5B9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
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