Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVQ3

LINC00854, Long intergenic non-protein coding RNA 854, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00854A0A1B0GVQ3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00854A0A1B0GVQ3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00854A0A1B0GVQ3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00854A0A1B0GVQ3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00854A0A1B0GVQ3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00854A0A1B0GVQ3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00854A0A1B0GVQ3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00854A0A1B0GVQ3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00854A0A1B0GVQ3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00854A0A1B0GVQ3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00854A0A1B0GVQ3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00854A0A1B0GVQ3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00854A0A1B0GVQ3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00854A0A1B0GVQ3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00854A0A1B0GVQ3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00854A0A1B0GVQ3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00854A0A1B0GVQ3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00854A0A1B0GVQ3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00854A0A1B0GVQ3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00854A0A1B0GVQ3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00854A0A1B0GVQ3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00854A0A1B0GVQ3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00854A0A1B0GVQ3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00854A0A1B0GVQ3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00854A0A1B0GVQ3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00854A0A1B0GVQ3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00854A0A1B0GVQ3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00854A0A1B0GVQ3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00854A0A1B0GVQ3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00854A0A1B0GVQ3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00854A0A1B0GVQ3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00854A0A1B0GVQ3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00854A0A1B0GVQ3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LINC00854A0A1B0GVQ3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00854A0A1B0GVQ3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00854A0A1B0GVQ3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00854A0A1B0GVQ3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00854A0A1B0GVQ3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00854A0A1B0GVQ3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00854A0A1B0GVQ3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00854A0A1B0GVQ3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00854A0A1B0GVQ3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00854A0A1B0GVQ3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00854A0A1B0GVQ3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00854A0A1B0GVQ3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00854A0A1B0GVQ3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00854A0A1B0GVQ3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00854A0A1B0GVQ3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00854A0A1B0GVQ3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00854A0A1B0GVQ3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00854A0A1B0GVQ3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC00854A0A1B0GVQ3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC00854A0A1B0GVQ3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00854A0A1B0GVQ3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00854A0A1B0GVQ3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00854A0A1B0GVQ3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00854A0A1B0GVQ3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00854A0A1B0GVQ3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00854A0A1B0GVQ3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00854A0A1B0GVQ3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00854A0A1B0GVQ3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00854A0A1B0GVQ3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00854A0A1B0GVQ3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00854A0A1B0GVQ3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00854A0A1B0GVQ3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00854A0A1B0GVQ3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00854A0A1B0GVQ3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00854A0A1B0GVQ3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00854A0A1B0GVQ3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LINC00854A0A1B0GVQ3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00854A0A1B0GVQ3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00854A0A1B0GVQ3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00854A0A1B0GVQ3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00854A0A1B0GVQ3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00854A0A1B0GVQ3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00854A0A1B0GVQ3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00854A0A1B0GVQ3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00854A0A1B0GVQ3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00854A0A1B0GVQ3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00854A0A1B0GVQ3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00854A0A1B0GVQ3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00854A0A1B0GVQ3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00854A0A1B0GVQ3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00854A0A1B0GVQ3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00854A0A1B0GVQ3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00854A0A1B0GVQ3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00854A0A1B0GVQ3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00854A0A1B0GVQ3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00854A0A1B0GVQ3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00854A0A1B0GVQ3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00854A0A1B0GVQ3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00854A0A1B0GVQ3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00854A0A1B0GVQ3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00854A0A1B0GVQ3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00854A0A1B0GVQ3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00854A0A1B0GVQ3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00854A0A1B0GVQ3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00854A0A1B0GVQ3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00854A0A1B0GVQ3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00854A0A1B0GVQ3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms