Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1U6

TRBV9, T-cell receptor beta variable 9 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV9A0A0B4J1U6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV9A0A0B4J1U6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV9A0A0B4J1U6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV9A0A0B4J1U6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV9A0A0B4J1U6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV9A0A0B4J1U6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV9A0A0B4J1U6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV9A0A0B4J1U6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV9A0A0B4J1U6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV9A0A0B4J1U6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV9A0A0B4J1U6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV9A0A0B4J1U6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV9A0A0B4J1U6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV9A0A0B4J1U6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV9A0A0B4J1U6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV9A0A0B4J1U6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV9A0A0B4J1U6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV9A0A0B4J1U6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV9A0A0B4J1U6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV9A0A0B4J1U6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV9A0A0B4J1U6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV9A0A0B4J1U6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV9A0A0B4J1U6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV9A0A0B4J1U6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV9A0A0B4J1U6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV9A0A0B4J1U6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV9A0A0B4J1U6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV9A0A0B4J1U6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV9A0A0B4J1U6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV9A0A0B4J1U6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV9A0A0B4J1U6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV9A0A0B4J1U6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV9A0A0B4J1U6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV9A0A0B4J1U6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRBV9A0A0B4J1U6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRBV9A0A0B4J1U6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV9A0A0B4J1U6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV9A0A0B4J1U6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV9A0A0B4J1U6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRBV9A0A0B4J1U6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV9A0A0B4J1U6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV9A0A0B4J1U6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRBV9A0A0B4J1U6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRBV9A0A0B4J1U6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRBV9A0A0B4J1U6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRBV9A0A0B4J1U6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRBV9A0A0B4J1U6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRBV9A0A0B4J1U6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRBV9A0A0B4J1U6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRBV9A0A0B4J1U6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRBV9A0A0B4J1U6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRBV9A0A0B4J1U6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRBV9A0A0B4J1U6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRBV9A0A0B4J1U6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRBV9A0A0B4J1U6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRBV9A0A0B4J1U6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRBV9A0A0B4J1U6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRBV9A0A0B4J1U6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRBV9A0A0B4J1U6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRBV9A0A0B4J1U6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRBV9A0A0B4J1U6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRBV9A0A0B4J1U6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRBV9A0A0B4J1U6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV9A0A0B4J1U6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRBV9A0A0B4J1U6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRBV9A0A0B4J1U6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRBV9A0A0B4J1U6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRBV9A0A0B4J1U6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRBV9A0A0B4J1U6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRBV9A0A0B4J1U6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRBV9A0A0B4J1U6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRBV9A0A0B4J1U6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRBV9A0A0B4J1U6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRBV9A0A0B4J1U6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRBV9A0A0B4J1U6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRBV9A0A0B4J1U6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRBV9A0A0B4J1U6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRBV9A0A0B4J1U6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRBV9A0A0B4J1U6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRBV9A0A0B4J1U6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRBV9A0A0B4J1U6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRBV9A0A0B4J1U6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRBV9A0A0B4J1U6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRBV9A0A0B4J1U6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRBV9A0A0B4J1U6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRBV9A0A0B4J1U6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRBV9A0A0B4J1U6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRBV9A0A0B4J1U6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRBV9A0A0B4J1U6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRBV9A0A0B4J1U6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRBV9A0A0B4J1U6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRBV9A0A0B4J1U6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRBV9A0A0B4J1U6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRBV9A0A0B4J1U6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRBV9A0A0B4J1U6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRBV9A0A0B4J1U6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRBV9A0A0B4J1U6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRBV9A0A0B4J1U6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRBV9A0A0B4J1U6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRBV9A0A0B4J1U6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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