Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D8

Zkscan5, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 5, mousemouse

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Length 819 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan5Q9Z1D8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
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Zkscan5Q9Z1D8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Zkscan5Q9Z1D8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zkscan5Q9Z1D8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Zkscan5Q9Z1D8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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Zkscan5Q9Z1D8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Zkscan5Q9Z1D8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Zkscan5Q9Z1D8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan5Q9Z1D8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms