Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU0

ACSL6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL6Q9UKU0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACSL6Q9UKU0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms