Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEFF2Q9UIK5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEFF2Q9UIK5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms