Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt6Q9R0N8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms