Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lsm4Q9QXA5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms