Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD3Q9NX63 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms