Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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