Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco4Q9JIS3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.5 ms