Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms