Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Swt1Q9DBQ9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Swt1Q9DBQ9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms