Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5T0

Atad1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad1Q9D5T0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Atad1Q9D5T0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atad1Q9D5T0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atad1Q9D5T0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atad1Q9D5T0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Atad1Q9D5T0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atad1Q9D5T0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atad1Q9D5T0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atad1Q9D5T0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atad1Q9D5T0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atad1Q9D5T0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atad1Q9D5T0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atad1Q9D5T0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atad1Q9D5T0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 341.5 ms