Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4933402E13RikQ9D4D2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms