Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC106Q9BWC9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms