Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rnf17Q99MV7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms