Protein–RNA interactions for Protein: Q99MK9

Rassf1, Ras association domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf1Q99MK9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rassf1Q99MK9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rassf1Q99MK9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rassf1Q99MK9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rassf1Q99MK9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rassf1Q99MK9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rassf1Q99MK9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rassf1Q99MK9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rassf1Q99MK9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rassf1Q99MK9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms