Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms