Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
STAMBPL1Q96FJ0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms