Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf144aQ925F3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf144aQ925F3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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