Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx15Q91WE1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx15Q91WE1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx15Q91WE1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx15Q91WE1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx15Q91WE1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx15Q91WE1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx15Q91WE1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx15Q91WE1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx15Q91WE1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx15Q91WE1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx15Q91WE1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx15Q91WE1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx15Q91WE1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx15Q91WE1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx15Q91WE1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx15Q91WE1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Snx15Q91WE1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx15Q91WE1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms