Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg8Q8VE18 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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