Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam20bQ8VCS3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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