Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc15Q8C9M2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms