Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc30Q8BVF4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms