Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptx4Q6RUU0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptx4Q6RUU0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms