Protein–RNA interactions for Protein: Q62521

Zic3, Zinc finger protein ZIC 3, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic3Q62521 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zic3Q62521 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zic3Q62521 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zic3Q62521 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zic3Q62521 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zic3Q62521 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zic3Q62521 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zic3Q62521 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zic3Q62521 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zic3Q62521 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zic3Q62521 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zic3Q62521 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zic3Q62521 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zic3Q62521 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zic3Q62521 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zic3Q62521 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zic3Q62521 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zic3Q62521 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zic3Q62521 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zic3Q62521 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zic3Q62521 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zic3Q62521 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zic3Q62521 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zic3Q62521 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms