Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mkrn3Q60764 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Mkrn3Q60764 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms