Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms