Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Mdc1Q5PSV9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mdc1Q5PSV9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms