Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB2

Gm12185, Predicted gene 12185, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12185Q5NCB2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm12185Q5NCB2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm12185Q5NCB2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.7 ms