Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRRT3Q5FWE3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRT3Q5FWE3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms