Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms