Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmtc2Q56A06 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmtc2Q56A06 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms