Protein–RNA interactions for Protein: Q562D6

Trmo, tRNA (adenine(37)-N6)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmoQ562D6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrmoQ562D6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TrmoQ562D6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.6 ms