Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TchpQ3TVW5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TchpQ3TVW5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TchpQ3TVW5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TchpQ3TVW5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TchpQ3TVW5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TchpQ3TVW5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TchpQ3TVW5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TchpQ3TVW5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TchpQ3TVW5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TchpQ3TVW5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TchpQ3TVW5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TchpQ3TVW5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TchpQ3TVW5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TchpQ3TVW5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TchpQ3TVW5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TchpQ3TVW5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TchpQ3TVW5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TchpQ3TVW5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TchpQ3TVW5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TchpQ3TVW5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TchpQ3TVW5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TchpQ3TVW5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TchpQ3TVW5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TchpQ3TVW5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TchpQ3TVW5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TchpQ3TVW5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TchpQ3TVW5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TchpQ3TVW5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TchpQ3TVW5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TchpQ3TVW5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TchpQ3TVW5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms