Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd11Q1RNF8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms