Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA9Q16790 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA9Q16790 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA9Q16790 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA9Q16790 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CA9Q16790 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CA9Q16790 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CA9Q16790 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CA9Q16790 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA9Q16790 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA9Q16790 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA9Q16790 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CA9Q16790 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA9Q16790 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA9Q16790 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA9Q16790 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA9Q16790 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA9Q16790 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA9Q16790 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA9Q16790 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA9Q16790 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CA9Q16790 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA9Q16790 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA9Q16790 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA9Q16790 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA9Q16790 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA9Q16790 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA9Q16790 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA9Q16790 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA9Q16790 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA9Q16790 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA9Q16790 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA9Q16790 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA9Q16790 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA9Q16790 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA9Q16790 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA9Q16790 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA9Q16790 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CA9Q16790 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA9Q16790 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA9Q16790 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA9Q16790 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA9Q16790 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA9Q16790 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CA9Q16790 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA9Q16790 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA9Q16790 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA9Q16790 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA9Q16790 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA9Q16790 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA9Q16790 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA9Q16790 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA9Q16790 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA9Q16790 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA9Q16790 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CA9Q16790 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA9Q16790 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA9Q16790 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA9Q16790 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA9Q16790 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA9Q16790 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA9Q16790 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA9Q16790 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CA9Q16790 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA9Q16790 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA9Q16790 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA9Q16790 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CA9Q16790 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA9Q16790 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA9Q16790 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA9Q16790 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA9Q16790 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA9Q16790 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA9Q16790 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA9Q16790 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA9Q16790 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CA9Q16790 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA9Q16790 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA9Q16790 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA9Q16790 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA9Q16790 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CA9Q16790 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA9Q16790 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA9Q16790 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA9Q16790 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA9Q16790 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA9Q16790 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA9Q16790 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CA9Q16790 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CA9Q16790 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CA9Q16790 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CA9Q16790 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CA9Q16790 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CA9Q16790 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CA9Q16790 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CA9Q16790 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CA9Q16790 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CA9Q16790 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CA9Q16790 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CA9Q16790 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
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