Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM28Q13263 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM28Q13263 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
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