Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 SLA1YBL007C 3735 nt3.34□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 RAD26YJR035W 3258 nt3.34□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 MIF2YKL089W 1650 nt3.33□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 YDL071CYDL071C 375 nt3.33□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 TRP4YDR354W 1143 nt3.33□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 BMH1YER177W 804 nt3.33□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt3.33□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 FOL2YGR267C 732 nt3.33□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 YIL086CYIL086C 309 nt3.33□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 REE1YJL217W 597 nt3.33□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 YKT6YKL196C 603 nt3.33□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 CDA2YLR308W 939 nt3.33□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 RSF1YMR030W 1131 nt3.33□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.33□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 URA2YJL130C 6645 nt3.33□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 SWI1YPL016W 3945 nt3.33□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 JEN1YKL217W 1851 nt3.33□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 ZDS2YML109W 2829 nt3.32□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 YDR391CYDR391C 699 nt3.32□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 YAL004WYAL004W 648 nt3.32□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 ALG1YBR110W 1350 nt3.32□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 CIT1YNR001C 1440 nt3.32□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 EPO1YMR124W 2832 nt3.32□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 MDN1YLR106C 14733 nt3.32□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 RSF2YJR127C 4143 nt3.32□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 SLM2YNL047C 1971 nt3.31□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 MNT4YNR059W 1743 nt3.31□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 RTT109YLL002W 1311 nt3.31□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 AAD3YCR107W 1092 nt3.31□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 SGN1YIR001C 753 nt3.31□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 ENT3YJR125C 1227 nt3.31□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 RRP36YOR287C 903 nt3.31□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 TGL1YKL140W 1647 nt3.3□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 TDA3YHR009C 1572 nt3.3□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 OAF3YKR064W 2592 nt3.3□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 MGA1YGR249W 1371 nt3.3□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 RMD1YDL001W 1293 nt3.3□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 HAT2YEL056W 1206 nt3.3□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 ERG26YGL001C 1050 nt3.3□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 CAP2YIL034C 864 nt3.3□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 ARC15YIL062C 465 nt3.3□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 HMX1YLR205C 954 nt3.3□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 MCK1YNL307C 1128 nt3.3□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 FAS1YKL182W 6156 nt3.3□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 POL31YJR006W 1464 nt3.29□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 CAF130YGR134W 3369 nt3.29□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 OTU1YFL044C 906 nt3.29□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 MTR2YKL186C 555 nt3.29□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 RFC3YNL290W 1023 nt3.29□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 DSE3YOR264W 1293 nt3.29□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 YMR1YJR110W 2067 nt3.29□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 PKH1YDR490C 2301 nt3.28□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 RNR1YER070W 2667 nt3.28□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 YOL019WYOL019W 1656 nt3.28□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 YVC1YOR087W 2028 nt3.28□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 RPC11YDR045C 333 nt3.28□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.28□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 VFA1YER128W 612 nt3.28□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 MTC3YGL226W 372 nt3.28□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 YUH1YJR099W 711 nt3.28□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 AIM39YOL053W 1188 nt3.28□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 PLP2YOR281C 861 nt3.28□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 YOR314WYOR314W 330 nt3.28□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 YPL168WYPL168W 1293 nt3.28□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 PRM15YMR278W 1869 nt3.28□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 DAP2YHR028C 2457 nt3.28□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 YHL012WYHL012W 1482 nt3.28□□□□□ -1.88
SNF8Q12483 RNT1YMR239C 1416 nt3.27□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 MRH4YGL064C 1686 nt3.27□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 RAD4YER162C 2265 nt3.27□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 PWP2YCR057C 2772 nt3.27□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 YLR352WYLR352W 2424 nt3.27□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 FAP7YDL166C 594 nt3.27□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 PCL9YDL179W 915 nt3.27□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 LSM6YDR378C 261 nt3.27□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 YER147C-AYER147C-A 411 nt3.27□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 OKP1YGR179C 1221 nt3.27□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 ARD1YHR013C 717 nt3.27□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 RAD33YML011C 534 nt3.27□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 MFA2YNL145W 117 nt3.27□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 SIL1YOL031C 1266 nt3.27□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 YOL050CYOL050C 321 nt3.27□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 RSC1YGR056W 2787 nt3.27□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 NUP60YAR002W 1620 nt3.26□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 ULP1YPL020C 1866 nt3.26□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 GPI1YGR216C 1830 nt3.26□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 APN2YBL019W 1563 nt3.26□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 NEM1YHR004C 1341 nt3.26□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 FCF1YDR339C 570 nt3.26□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 ERJ5YFR041C 888 nt3.26□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 YJR037WYJR037W 384 nt3.26□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 TSR1YDL060W 2367 nt3.26□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 LCB5YLR260W 2064 nt3.26□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 VPS53YJL029C 2469 nt3.26□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 MEK1YOR351C 1494 nt3.25□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 ATG21YPL100W 1491 nt3.25□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 YCR085WYCR085W 354 nt3.25□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 PSF1YDR013W 627 nt3.25□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 STE14YDR410C 720 nt3.25□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 SFH5YJL145W 885 nt3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 41.3 ms