Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms