Protein–RNA interactions for Protein: Q05A36

Mex3c, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mex3cQ05A36 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mex3cQ05A36 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mex3cQ05A36 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1159.6 ms