Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms