Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bop1P97452 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bop1P97452 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bop1P97452 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bop1P97452 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bop1P97452 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bop1P97452 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bop1P97452 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bop1P97452 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms