Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Taf1bP97358 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Taf1bP97358 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Taf1bP97358 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Taf1bP97358 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Taf1bP97358 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Taf1bP97358 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf1bP97358 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Taf1bP97358 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Taf1bP97358 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Taf1bP97358 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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