Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTP1P59025 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTP1P59025 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTP1P59025 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTP1P59025 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTP1P59025 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTP1P59025 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTP1P59025 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTP1P59025 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTP1P59025 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTP1P59025 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTP1P59025 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTP1P59025 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTP1P59025 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTP1P59025 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTP1P59025 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTP1P59025 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RTP1P59025 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTP1P59025 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTP1P59025 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTP1P59025 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTP1P59025 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTP1P59025 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP1P59025 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP1P59025 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP1P59025 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP1P59025 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP1P59025 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP1P59025 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP1P59025 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP1P59025 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP1P59025 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP1P59025 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP1P59025 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP1P59025 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP1P59025 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP1P59025 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP1P59025 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP1P59025 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP1P59025 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP1P59025 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP1P59025 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP1P59025 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP1P59025 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP1P59025 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP1P59025 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP1P59025 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTP1P59025 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTP1P59025 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTP1P59025 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTP1P59025 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTP1P59025 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTP1P59025 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTP1P59025 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTP1P59025 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTP1P59025 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RTP1P59025 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTP1P59025 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP1P59025 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP1P59025 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP1P59025 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP1P59025 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP1P59025 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP1P59025 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP1P59025 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP1P59025 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP1P59025 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP1P59025 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP1P59025 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP1P59025 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP1P59025 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP1P59025 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP1P59025 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP1P59025 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP1P59025 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP1P59025 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP1P59025 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTP1P59025 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTP1P59025 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTP1P59025 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTP1P59025 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTP1P59025 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTP1P59025 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTP1P59025 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTP1P59025 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RTP1P59025 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTP1P59025 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RTP1P59025 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTP1P59025 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTP1P59025 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTP1P59025 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTP1P59025 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTP1P59025 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RTP1P59025 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTP1P59025 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTP1P59025 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTP1P59025 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTP1P59025 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTP1P59025 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTP1P59025 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms