Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fgd1P52734 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.3 ms