Protein–RNA interactions for Protein: P49682

CXCR3, C-X-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR3P49682 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms